第二，建立新型的成本、费用控制制度。在新经济条件下，不能沿用传统的成本、费用控制制度，那将限制科技创新活动的开展，也不利于发挥各部门和个人的专业特长。新经济是建立在开发式、竞争性的市场上的，更加注重科技成果的创新和产业化。我们传统的成本、费用控制往往与科技创新、市场价值分析相脱节，单纯追求费用的节省和成本的降低。因而，成本、费用控制制度的创新显得非常重要。成本、费用控制制度要面向市场、面向未来，要做到产、学、研良性互动。政府应当制定一些规范性、指导性的成本、费用控制制度，具体如何操作，企业可以根据实际情况，灵活加以运用。比如，在许多不成功的项目上投资，花费了大量的成本、费用，在传统经济下，企业的内部控制制度是不允许的，而在新经济条件下，这完全是正常现象，不必大惊小怪。
第三，建立新型的投资控制制度。在新经济条件下，企业的投资控制不能按传统的办法进行，而应当更加关注投资风险问题，关注投资的最终价值的实现。投资控制应当更加民主化、法制化、科学化，更充分地发挥专家集体的智慧，更加关注对高科技、对人类生存环境有利项目的投资。在投资方案的评价方面除了要考虑传统的一些经济指标外，要更加注重社会价值与环境价值指标的评估，关注投资对员工价值的影响，关注投资对企业未来创新能力、发展能力和核心竞争能力的影响，关注投资对企业员工精神风貌的影响。
第四，建立新型的分配控制制度。在新经济条件下，企业的分配控制制度也应当大胆改革创新。对员工的分配、对创新的分配、对无形资产的分配、对资本的分配、对管理人员及技术人员的分配，都应当更加科学化、民主化、制度化，这样才能更加有利于新经济的运行，更加有利于全部资源的优化配置。这种新的分配控制制度应当更加注重有利于新经济的各种创新的价值，应当在科学测评各种资源的附加价值的基础上，控制新增加价值的合理再分配。
第五，建立新型的内部控制关系。在新经济条件下，必须对那种自上而下层层控制的内部控制方式，在借鉴发达国家先进经验的基础上、结合中国的国情和文化，进行彻底改革。在目前经济全球化的进程中，我国企业在建立新型的内部控制关系时，应考虑以下因素：一是企业内部控制要重视伦理道德规范建设。西方国家强调的是法制，我们也在向法制化国家靠拢。但我们也强调“以德治国”。企业内部控制应当建立在共同的伦理道德规范的基础上，形成真正意义上的团队精神。只有当企业中的每一个员工都信仰明确、思想鲜明，内部控制才更有实效。在新经济下，伦理道德具有极高的价值。企业内部控制的逻辑起点应当是“修己安人”，“修己”就是自我管理，而自我管理是未来企业内部控制的总纲。二是企业内部控制要充分体现以人为本思想。我国传统文化是儒家文化，以人为本是儒家管理文化最鲜明、最重要的特色和标志。企业内部控制要强调沟通和感情的交流，减少管理者与被管理者之间的隔膜。这才更有利于企业形成强有力的群体，调动每一个人的积极性。三是企业内部控制要重视集体主义精神建设。每个人要注意自身行为修养，提升自己的人格境界，控制好自己的行为，创造一个良好的人际关系环境空间，大家相互支持、相互激励，充分发挥自己的主观能动性。只有形成了这种良性互动机制，企业内部控制才能在新经济条件下实现质的飞跃。四是企业内部控制的最高境界（目标）是实现“无为而治”。“无为而治”即自我控制，自我管理。在新经济下，一个企业的每一个成员都能自发、自觉地按照规范和目标行事，发挥自己的潜力，维护企业的利益，努力实现企业目标。要注意各种关系的协调，力争做到整体和谐、动态优化，达到内部控制“无为而治”的最高境界。因此，企业内部组织的高度默契是“无为而治”的前提，我国企业内部控制的目标应当是向“无为而治”迈进。
